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在密支那休整期间，重庆的"军委会"下令对中国驻印军的编制作了一些调整，扩建为新一军和新六军两个军。孙立人中将被任命为新一军军长，孙将军留下的遗缺－－新三十八师师长一职由久经锻炼、战功卓著的原一一四团团长李鸿升任，新三十师师长胡素少将奉调回国，其职由原新三十八师副师长唐守治少将继任。李鸿留下的一一四团团长遗缺由该团第一营营长彭克立继任。新一军辖新三十八师、新三十师和潘裕昆少将指挥的五十师，共三个师。在密支那期间，兵员都做了补充。
新一军的参谋长和副参谋长分别由上级派来史说少将和原新三十八师副参谋长张炳言上校担任，原新三十八师副师长葛南杉少将，因新三十八师是孙将军亲自训练和培育出来的英雄劲旅，其政工工作至关重要，为了协助李鸿治军，故仍留任原职。唐守治和李鸿的晋升自然是根据孙将军推荐，且经重庆政府"军事委员会"批准的。李鸿自1937年底在第四十四师就任团长，自税警四团以来，他对孙氏忠心耿耿，在抗战的伟业中屡建奇功，久经考验，继承孙将军升任新三十八师师长自属理所当然。
新一军的各处处长，除了军械处长由上级派来毕业于陆军大学的胡甲里上校担任外，原军法处长潘伯坚上校和副官处长张其礼上校请假回国，其职务分别由彭炼中校和黄桓醒中校升任，其他各处处长差不多均由原新三十八师的各处处长升任，师的各处室负责人均改称主任。
与此同时，廖耀湘晋升为新六军中将军长，辖新二十二师和龙天武的十四师两个师，他留下的新二十二师师长遗缺，由原副师长李涛少将继任。
扩建命令下达后不久，郑洞国将军立即带领他的原新一军参谋长舒适存将军等幕僚班子回国了，虽然两个月后史迪威去职，美国的索尔登将军，被任命为中国驻印军的总指挥，郑洞国将军被任命为副总指挥，但实际上郑洞国将军并未到任履新。
密支那扩编时，军没有直属部队、直到部队回国前，总指挥部才把原属总指挥部的直属部队，调拨给新一军。他们是：特务营、通信营、工兵营、重炮营、榴弹炮营、重迫炮营、汽车营、战车第一营，搜索营、骡马辎重兵营。教导总队和军兽医所。
军野战医院是在密支那成立的，鹰扬京剧团原属新三十八师，都不是总指挥调拨的。
军医处的其中一名中校军医卞声宏，虽然是半路出家改学军医，但他天资聪颖，上进心强，又有组织才能和独当一面的工作能力，所以他很快就成为军医处的骨干。抗战胜利后，他在台湾获得医学博士学位，现在美国纽约金斯勃精神病医疗中心（KingsbowPsychiatriccenter）的精神病学专家。在美国的诸多朋友中，卞声宏非常尊敬孙将军，至今仍在怀念他。
师军医处主任一职空缺后，由张涤生接任。
在一年多的战斗中，李鸿对张涤生的学识，医疗经验和战地救死扶伤的精神，都感到非常满意，因为张也得到孙将军的器重与赞赏。这既说明孙将军的爱才如渴，也证实张涤生献身军旅报效祖国的赤诚。战后，张出国深造，终成国际著名整复外科和显微外科专家，这些成就实与其参加驻印军分不开的。
利用这为时不长的休整时间，原军医处处长遵照孙将军的要求，编写了一份新三十八师在北缅作战的卫生勤务年报，对防病、治病、战上、手术、阵亡、伤运、伤残治愈率、康复率、重返前线杀敌者以及尔后应注意的事项等等均作了全面详细的分析和整理，刊于新三十八师的战报上；另外还写了一篇题为"北缅战场的流动手术队"的文章，刊于1945年成都发行的英文版《中华医学杂志》上。
根据粗略统计，在第一阶段的缅战中，新三十八师伤亡总数约为3500余人，伤与亡人数之比为3∶1，阵亡者不到900人，约有60%的伤者，伤愈后可重返前线，不仅增强了师战斗力，且大大鼓舞了士气，至于因病而需住院者，更是寥寥无几。
在休整期间，不仅鹰扬剧团赶来为各团、营进行慰问演出，重庆政府也在8月份派来一个以某女社会名流为首的大型慰问团飞抵密支那，并带来了一个歌舞团，为新一军官兵进行了多场慰问演出。
随慰问团来密支那的还有电影艺术大师郑君里和赵丹，他们两位曾访问了新一军军医处，对部队在国外的卫生勤务工作分外关心，对驻印军的医疗体系、指挥系统、占地急救、伤患运输、发病率、康复率等问题颇为关心。他们两位对于新三十八师战果之丰硕、伤亡病患之少，精神面貌之振奋，都表示相当钦佩；并且从他们那里得知，驻印军，尤其是新三十八师在缅甸战场上为国争光的卓越表现，已经引起国人的普遍关注，这一点使全军的兄弟们深受鼓舞。
附1944年中国驻印军密支那扩建后组织及指挥系统
中国驻印军：
总指挥：史迪威中将
副总指挥：郑洞国中将(未到任履新)
参谋长：鲍特纳准将
副参谋长：坎能上校
战斗部分：
新一军：军长孙立人将军
新编三十师：师长唐守治少将
新编三十八师：师长李鸿少将
第五十师：师长潘裕昆少将
新六军：军长廖耀湘中将（1944年11月奉调回国）
第十四师：师长龙天武少将
新编二十二师：师长李涛少将
直属部队：
战车营：营长赵振宇上校（只装备起一营）
独立步兵第一团：团长徐懋禧上校
重迫击炮第十一团：团长林冠雄上校
高射炮兵第一营
炮兵兵团（155mm）
汽车兵团：团长曹艺上校
辎重兵团
工兵：
第一工兵营
工兵第十团：团长李乐中上校
工兵经十二团：团长梁可发少将
独立通信兵营
特务营
宪兵独立第三营
教导第三团
运输第十二大队
军直属部队
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